通过选出的优良公、母纯种进行人为控制配对，使优良基因更好地重新组合，促进猪群的改良与提高，通过选配可以把握必要的变异方向，促进某种变异，克服缺点，并能稳定遗传性，把理想性状固定下来，巩固优点。选择亲和力好的种公、母猪交配，获得更理想的后代。

种猪的选配方法主要有品质选配（包括同质选配、异质选配）和亲缘选配两种，现分述如下。

1、品质选配品质一般是指体质、体型、生物学特性、生产性性能和产品质量等方面，也可指遗传品质。品质选配是考虑交配双方品质对比的选配，根据相配猪的品质对比，可分为同质选配和异质选配。

（1）同质选配：即选用性能和外形相似的优秀公、母猪来配种，使亲本的优良性状稳定地遗传给后代，使优良性状得到保持和巩固，以期获得与亲本（公、母猪）优良性状相似的优良后代个体。

（2）异质选配：异质选配可以选择具有不同优良性状的公、母猪配种，以获得兼有双亲不同优点的后代；也可以选同一性状但优劣程度不同的公、母猪配种，使纯种后代有较大的改进和提高，生产高质量的纯种，才能更好地产生高产的杂种。

2、亲缘选配亲缘选配是根据种公母猪亲缘关系远近进行选配的一种方法。当猪群中出现优秀个体时，为了尽可能保持优秀个体的特性，揭露隐性有害基因，提高猪群的同质性，可采用亲缘亲配。为了防止近亲交配（双方共同祖先的总代数不超过6代）而造成的繁殖性能，生活力和生产力下降等遗传缺陷衰退现象，应严格控制近亲交配系数的增大。一般繁殖场和商品猪场应避免近亲交配。但近亲交配运用得当，可以加速优良性状的巩固和扩散，揭露隐性有害基因，提高猪群的同质性，是育种工作中的一个重要手段。为了避免交过程中出现衰退现象而造成损失，在使用近亲选配时，一般只限于培育品系（包括近亲系）以及为了固定理想性状才可用各种不同程度的近亲交配。