FMDV是细胞内增殖，其免疫应答依赖于T细胞，因而细胞因子免疫性在抗病毒防御方面起着特别重要的作用。鉴于此，人们FMDVB细胞或T细胞抗原表位与发的蛋白质分子基因或与形成类病毒粒子（Viruslikeparticle）的结构基因融合，利用载体基因蛋白或类病毒粒子的抗原提呈作用，刺激T细胞，增殖机体细胞免疫反应。Bittle根据FMDVO1型VP1氨基酸序列，化合合成140-160段氨基酸肽与载体蛋白偶联，能诱导保护豚鼠的中和抗体。Broekhuijsen在β半乳糖苷酶N-末端连接VP1基因的B细胞和T细胞抗原表位单拷贝或多拷贝分子，用表达的融合蛋白接种豚鼠，能诱导高水平的中和抗体，刺激T细胞，产生细胞免疫应答，抵抗强毒的攻击。同年Clarke利用乙型肝炎病毒核心蛋白能自我包装成类病毒粒子，将FMDV的B细胞和T细胞抗原表位连接到其蛋白的N-末端，并在痘病毒中表达，其表达的融合N蛋白在豚鼠和猪中都可诱导高水平的中和抗体。Chan将FMDVVP1的141-160aa和200-213aa串联起来与猪IG的重链基因的末端融合，用其表达产物免疫的猪，可以抵抗50LD50的FMD的攻击。由于蛋白质载体疫苗安全性高，免疫原性好，故具有诱人的应用潜力。