10月上旬当归叶发黄时，割去地上部使太阳晒到地面，促使根部成熟。10月下旬挖当归，从地的一端开始挖，尽量挖全。挖后结合犁地再捡一次漏挖的药。

当归收挖后，及时抖净湿土，挑出病烂根，掰去残留叶柄，待水分稍蒸发后，扎成0.5～1千克重的扁平把子，放在干燥通风的室内或特制的熏棚内。熏棚架高1.3～1.7米，上面铺竹条，将当归把子平放与立放相间铺在上面，厚30～50厘米，用豆秆、湿白杨、柳木等作燃料，用水喷湿生火燃烟，使当归上色，至当归表皮呈赤红色，再用煤火或柴火熏10天左右，接着翻棚，翻棚后用急火熏2天，再用文火熏干。