种子必须完全成熟。在植株叶片黄枯、茎干枯、豆荚变褐色或黑褐色、豆粒干硬并与荚壁分离、摇动植株时荚内发出响声但豆荚尚未开裂前收获。拔株或割株收获，脱粒，过筛，充分晒干后贮藏。为确保种子纯度，留种田与不同品种间应相距100～150米。

南方春播早毛豆的鼓粒和种子成熟期正值当地多雨季节，种子常常不能充分成熟，而且容易在植株上发芽或霉烂，种子质量差。收后又须经过高温多湿的夏季贮藏，呼吸消耗多量营养物质，到翌年早春播种时，发芽率低，在10℃以下发芽率不足30%，而且常因地温低而烂种。为提高种子质量以适应早春播种的需要，各地基本上采用的是下面两种留种方法。

1.秋繁留种春播的毛豆到7月上中旬、叶子转黄脱落、茎秆呈草枯色、全株80%～90%的荚变黄褐色、种粒已与荚壁分离、种子半干硬时就收获。收后立即播种。春毛豆秋播时，生育期偏短，营养体也小，可适当密植，每公顷保苗42万～45万株，确使秋繁种子高产。播种时每公顷施300～375千克过磷酸钙作种肥，1～2个真叶期追75千克左右氯化钾或150千克复合肥，扬花和结荚期各喷1次0.2%磷酸二氢钾液。10月上旬前后种子成熟，收后晒干贮藏，供翌年早春播种用。

秋繁早毛豆的种株开花结荚时温度较低，阳光充足，故籽粒大、饱满充实。收后又在自然低温下贮藏3～4个月，翌春种子完好无损，生活力强，在10℃左右的低温下播种时出苗率可达90%左右，能保全苗。

而且幼苗的抗逆力和适应性强，与原种后代的性状无甚差别，能早熟高产。但是秋繁留种4～5年后会出现豆荚和种子逐渐变小、产量下降的退化现象，尤其是上年春季用育苗移栽法种的早毛豆，经秋繁后的退化更为严重。这可能与移栽毛豆的根系发育差和秋繁时种子的生理成熟度不足有关。同时，秋繁种株因营养生长期短，发育快，产量较低。

2.北繁留种将南方的早毛豆安排到北方繁种。如移到黑龙江春季繁种。在黑龙江播后的生育期内，每天平均日照比江苏省镇江市长1.5小时，有利延长毛豆的营养生长期，增加单株茎节数。秋季日照逐渐缩短时开花结荚，鼓粒后温度渐降，气候干燥，昼夜温差大，适合籽粒的充实和成熟，种子产量好，质量好，可充足供应南方春季生产用种。而且，东北大豆都行机械化作用，种子生产成本低。但是南方品种在日照长的北方种时，会延长生长期，遇秋霜早降的年份就难以完熟。所以，北繁留种时应根据品种的生长期，选择好适合的地点，使种子能及时充分成熟。