留种用的果实老熟以后，可采下放置在室内7-10天，等待其后熟。后熟后使种子与果肉分离，然后切成数块，除去果实的两端而留中间一段，果肉在水中捣烂以后揉出种子，充实的种子会沉在水中，然后从水中取出洗净。先阴干，再用布遮盖晒干，遮布的作用是避免强光晒伤。种子多少视品种而异，如成都墨茄每100公斤果实约可采收种子0.6公斤。茄子不同品种有一定的杂交率，不过只要两个不同的品种间相距50米以上时，就很少有杂交机会。