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一、防疫不当
　　1.不按程序防疫
　　需要严加控制的传染病主要有猪瘟、猪丹毒、猪肺疫，常用的疫苗是猪瘟疫苗、猪瘟-猪丹毒-猪肺疫三联弱毒冻干苗。以猪瘟兔化弱毒真空冻干苗为例，用灭菌生理盐水稀释后，大小猪一律肌肉或皮下注射1ml，注射后4天产生坚强免疫力，断奶仔猪可保护一年半。仔猪预防接种应在2月龄时进行，留种者应每年加强免疫一次，在疫区更应提前接种，断奶后再接种一次。农村散养户往往怕麻烦，不管是否疫区，一般只选择在1月龄接种1次，留种者也不再作加强免疫。也有的养猪户，压根儿就没有接种这回事。
　　2.疫苗缺乏
　　在某些乡镇，除猪瘟兔化弱毒苗、猪瘟-猪丹毒-猪肺疫三联苗等几种疫苗外，其它疫苗不易买到。
　　3.疫苗效价不高
　　一些个体兽医丧失起码的职业道德，使用超过有效期的疫苗或已失效的疫苗，或将疫苗故意低浓度稀释，或疫苗注射剂量不足，这些都严重影响了疫苗应有的作用，致使免疫后照样还会出现疫病暴发。
　　4.操作不规范
常见的是疫苗保存不当，不使用灭菌生理盐水稀释疫苗，注射疫苗时一个针头用到底，既不更换针头，也不严格消毒。
　　二、治疗不力，导致耐药菌株产生
　　1.超量、胡乱使用抗菌药物和激素药物
　　许多人没有经过专门的职业训练，单靠放养猪的经验，或者凭着一股敢闯敢拼的劲头，就敢立起门头来作兽医，遇到病猪就只知道使用青霉素、链霉素、地塞米松。在他们的意识中，这个组方就是“万能处方”。殊不知，这个“万能处方”也有一定的抗菌范围。如果效果不明显，往往又会盲目地加大用药剂量，有时甚至会超出常量的几倍、十几倍甚至几十倍。对于不敏感的微生物，过量使用抗生素，不但不能杀死或抑制，相反会使微生物增加对药物的耐受性，使动物感染性疾病越来越难治疗。地塞米松是激素类药物，适量应用有抗炎、抗过敏、抗毒素、抗休克等作用，但长期过量应用，会扰乱体内激素分泌，降低机体免疫力，不利于今后的疾病防治。
　　近几年，在使用抗生素治疗传染性疾病见效不快的情况下，一些人开始选择使用磺胺类药物，如磺胺嘧啶(SD)、磺胺间甲氧嘧啶(SMM)、磺胺二甲氧嘧啶(SDM)、复方新诺明(SMZ)等。这本来是个值得称道的做法，但可惜的是，一些人并不知道(有时根本就不理会)磺胺类药物只能抑制细菌生长的特点，或者长期使用磺胺药，或者不遵守“首次突击量，以后用维持量，症状消失后使用最小量”的用药规律，使原来对磺胺药比较敏感的微生物开始耐药。
　　2.盲目联合用药
　　有些农户根本不懂药物之间的相互作用，碰到猪生病就自己胡乱买药配药；有些兽医也糊弄农户，喜欢用大处方，以期大幅度提高治疗费。在这种情况下，不但可能会使药物之间产生拮抗作用，降低疗效，还很有可能使病原菌产生变异，导致抗药性产生。临床常见的不合理配伍用药很多，如：庆大霉素与青霉素、5%的NaHCO3；链霉素与庆大霉素、卡那霉素；酵母片与复方新诺明、磺胺脒；20%磺胺嘧啶钠与青霉素G钾、Vc注射液等等。
　　3.治疗不彻底
　　因为怕花钱，有些农户在猪得病后不按时给药，有时宁肯使用劣质兽药，有时在病情稍稳定后立即停止用药。任何一种药物在体内维持药效的时间总是有限的，当药物降低到一定浓度时就必须及时补充用药，否则，病原菌就有可能在含有较低药物浓度的机体内顽强生长繁殖，逐步产生耐药性，甚至发生变异，给今后的治疗工作带来较大难度。
　　4.新药成分不明，使用不规范
　　现在市面上的兽药品种十分繁杂。新药往往都有一个神乎其神、让人真伪难辩的名字，标签上介绍的应用范围特别广、效果特别好，但又不标明有效成分。大部分抗病毒化学药物都仅仅只能抑制病毒，如：阿糖腺苷防治仔猪伪狂犬病，磷甲酸钠防治猪伪狂犬病，靛红-β-缩氨硫脲防治猪痘，都是通过抑制病毒复制来发挥作用的。况且有些抑制病毒的药物还具有明显的副作用，如：病毒唑可用于治疗流感病毒和痘病毒感染，但长期使用，会对机体产生毒害作用；利巴韦林在组织培养中，对病毒有抑制作用，但长期服用，容易产生免疫抑制等等。病毒对现有抗病毒药物都能产生耐药性变异株，甚至还会出现依赖药物的变异，使抗病毒药物效果不佳或根本无效。一些养殖户很容易随便接受、使用一些新药。有个别兽医也都喜欢使用新兽药，目的是好抬高药价，谋取高额利润。其实，那些新药虽然效果确实不错，其主要成分仍然是抗生素，但如果使用不规范，也很容易使病原菌产生耐药性，缩短这些药物的使用寿命，步青霉素、链霉素之后尘。