养殖波尔山羊的药物预防，有些疾病尚无疫苗或不宜用疫苗预防，在这种情况下可采用药物预防。比如，在羔羊大肠杆菌病多发季节，在饲料中添加一定量的抗生素。肉牛可以达到预防或减少羔羊大肠杆菌病发生的作用。在饲料中添加一定量的硫酸铜可有效的预防羔羊摆腰病。在饲料中添加亚硒酸钠可预防波尔山羊白肌病。在肉羊饲料中添加一定量的硫酸锌可以预防蹄病。有些病毒性疾病威胁波尔山羊，给羊注射干扰素可预防一些疾病的感染。

　　不过，应该指出，4月龄以上的波尔山羊，由于瘤胃已发育正常，在饲料中长期添加抗生素来预防疾病，会产生一定的副作用。