处理储奶间废物有很多种方法，但针对特定形式，每种处理方法都有其各自的优点和缺点。所以挤奶中心的卫生和挤奶操作要选择符合自己的实际的正确方法。
储奶间最佳管理实践
　　储奶间是牧场原料奶质量控制最后一个环节，是专门用于冷却和储藏牛奶的场所。所以必须保证挤奶厅的清洁卫生，以及良好的排水系统。
挤奶厅排水包括挤奶设备和奶罐清洗水，地面排水应该有一个沉淀桶，滞留较大的固体。排水系统必须易于清洗气体的排放，保证储奶间和挤奶中心气味排放。排水系统应该按时清洗，避免阻塞。
　　建议排水系统与牧场奶罐出口的距离最小保持在60厘米，不要直接位于奶罐下面，这主要是避免奶罐出口被污染。
运动场和育肥场最佳管理
　　运动场和育肥场是牛粪、细菌、杀虫剂和其它化学危害来源的主要区域，同时也是能增加家畜创伤危险的场所，所以要加强运动场和育肥场的管理和维护，限制奶牛接近牛粪和废弃物储存地。
　　同时，运动场的设计要兼顾到安全和清洁的两方面的要求。因为运动场始终是湿的，而且动物运动也非常普遍，所以在铺设运动场时要选用防滑材料，并且易于排水(无污染的)，像雨水、雪水、屋顶和房檐水，当它们接触运动场牛粪之前，要及时排走。
牛群通道
　　建筑和维持适宜的通道和交通区域，是预防环境乳房炎和保持乳房清洁的有效措施。
　　奶牛不应该无限制地接近牛奶或饲料运输工具经过的操场和通道部分。由于土壤和牛粪能粘附到卡车或卡车轮胎，所以牧场操场或通道的牛粪积累被认为是污染的可能来源之一。
　　确保通道设计与适当规模的奶牛转移相配套，例如5米宽的通道适合小于200头奶牛。奶牛过道路面千万不要使用砂石，因为砂石能引起奶牛蹄子擦伤。
牧草最佳管理
　　1.杀虫剂的使用和杂草控制
　　牧场使用的杀虫剂或其它化学物质须是牛场允许使用的产品。农场使用的所有化学物质，无论其是否是奶牛专用药物，都必须避免药品进入饲料、乳和肉中。应用批准使用的杀虫剂来控制内部和外部的寄生虫。当为牧场和草场使用杀虫剂时(例如除草剂)，一定要按照标签说明操作，并提供适当的储存设施以存放杀虫剂、药物处理的种子和化肥。
　　2.放牧管理
　　牧场管理的最佳目标就是能将奶牛生产需要与牧场质量和牧草可利用程度相平衡，同时降低化学性、生物性和物理性对原料奶发生危害的风险。如果必要的话，可以通过评价牧草质量、牧草供应情况和牛粪积肥情况，适当减少放牧密度。