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规模化肉牛业综合性防疫体系的建立必须以兽医流行病学、家畜传染病学的基本理论为指导，依据兽医法律、法规的要求，根据养牛生产的规律性，在日常生产中全面系统地对牛群实行保健和疫病管理。
1．隔离：将牛群控制在一个有利于防疫和生产管理的范围内进行饲养的方法称为隔离。隔离是国内外普遍采用的最有效的基本防疫措施之一。
2．消毒：是采用现代化手段杀灭生产环境中病原
体的一项技术措施，其目的在于切断疫病的传播途径，防止传染性疾病的发生与流行。
(1)消毒分类。①日常消毒：主要有定期对栏舍、道路、牛群的消毒，定期向消毒池内投放消毒剂等；临产前对产房、产栏及临产母牛的消毒，人员、车辆出入栏舍、生产区时的消毒等；饲料、饮水、空气的消毒；医疗器械的消毒。②即时消毒：是当牛群中发生-般性疫病或突然死亡时，立即对其所在栏舍进行局部强化消毒。③终末消毒：主要用于全进全出系统中，或在疫病流行平息后，解除封锁前的大消毒。
(2)常用消毒方法。①物理消毒法：主要包括机械性清扫刷洗、高压水冲洗、通风换气、高温高热(灼烧、煮沸、烘烤、焚烧等)和干燥、光照(日光、紫外线光照射等)。②化学消毒法：是消毒中最常用的方法之一。使用化学消毒剂时，应考虑病原体对不同消毒剂的抵抗力、消毒剂的杀菌谱、有效使用浓度、作用时间、对消毒对象及环境温度的要求等。③生物学消毒法：对生产中产生的大量粪便、粪污水、垃圾及杂草等用发酵法利用发酵过程所产热量杀灭其中的病原体。可采用堆积发酵、沉淀池发酵、沼气池发酵等。还可采用固液分离技术，将分离之固形物制成高效有机肥料，液体经发酵后用于渔业养殖。
(3)消毒设施和设备：主要包括场和生产区大门的大型消毒池、牛舍出入口的小型消毒池、人员进入生产区的更衣消毒室或淋浴更衣室及消毒通道，消毒处理病死牛尸体的尸体坑，粪污的堆积发酵场、发酵池等。常用消毒设备有喷雾器、高压清洗机、高压灭菌容器、煮沸消毒器、火焰消毒器、粪污的固液分离器等。
(4)消毒程序：如全进全出系统中的空栏大消毒的消毒程序可分为清扫----高压水冲洗----喷洒消毒剂----清洗----熏蒸----干燥----喷洒消毒剂----转进牛群。消毒程序应根据不同因素因地制宜地加以制订。及对生产环节中关键部位的消毒效果进行检测。
(5)消毒制度：明确消毒工作的管理者和执行人，使用消毒剂的种类及其使用浓度、方法、消毒间隔时间和消毒剂的轮换使用，消毒设施设备的管理等。
3．杀虫、灭鼠：杀灭蚊蝇等节肢媒介昆虫和老鼠，是消灭疫病传染源和切断其传播途径的有效措施，是综合性防疫体系中环境控制的重要措施。