7月12日，农业部微生物产品质量监督检测测试中心（武汉）出具鉴定报告，确定该公司生产的微生物菌剂有效活菌总数不符合产品标识，属于伪劣产品。

报告上显示：二份送检的该“微生物菌剂”肥料样品，实测枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、有效活菌分别为0.2、0、0.20亿/克和0、0、0，不符合产品标示的分别≥0.01、≥0.01、≥2亿/克的要求。换句话说，其中一份送检肥料有效活菌总数只有产品标示量的十分之一，另一份完全为0。

综合之前现场会的情况，温岭警方判断这背后可能涉及一个较大的制假售假团伙，遂将这一线索上报至台州市公安局食药环支队，支队立即抽调市县两级公安机关精干警力成立专班开展工作，初步确定是一起特大跨省生产、销售伪劣肥料案件。

8月15日，该案正式刑事立案，次日警方成立专案组，由食药环支队会同温岭公安公安局组织民警及农业农村和水利局同志赶赴江苏连云港、山东临沂等地展开追查核实。

专案组综合运用多种侦查手段，经过一段时间的蹲守、排摸，逐渐摸清了这一生产销售伪劣肥料团伙的整个链条运作情况，包括人员组织分工、活动规律，存储仓库、生产灌装窝点以及上下线情况等。