不过，不论是李纪顺还是李德军，他们面临的难题是：纯自然的生物农药研发难倒是其次，老百姓不认可才是最棘手的。比如说上述木霉菌粉末，在山东蔬菜大棚种植区推广了20年，应用面积却不超过总数的1/10。
　　“由于杀虫效果反应慢、使用要求较高等原因，施用生物农药后多数要在三四天后才能见到效果，不符合农民‘药到虫除’的用药心理。”杨合同分析，生物药成本相对较高。比如，生物农药“康宽”防治危害果蔬的斜纹夜蛾，一亩一次用药成本就需24元，而普通化学农药可能只需4元。
　　但生物药成本也并不是绝对的高。若打化学农药，一亩地打4桶药水，每桶7元钱;用木霉菌剂，每桶3元钱就够了，省一半。不过，在药残蔬菜横行市场，菜价相对不高的前提下，讲求“性价比”的农民通常还是愿意选择“见效快”的化学农药。
　　记者了解到，生物农药也有成功推广的实例。如获2014年度国家科技进步二等奖的新型天然蒽醌化合物农用杀菌剂对农作物的防病效果达到90%以上，且蔬菜、水果喷药后第二天就可食用。自2008年推广以来累计使用超过2000万亩，增收节支近50亿元。
　　杨合同建议，“我国应借鉴发达国家经验，在政策、资金、平台建设等方面对生物农药予以全面扶持，通过统防统治进行推广。同时加强宣传，提升相关群体对生物农药的认知度，打破‘企业不爱、农民不买’的僵局。”