当归秋季直播在第二年，移栽的在当年，于10月中旬植株枯黄后收获。各地自然条件不同，收获时间也有一定差异。如甘肃岷县在霜降后3～5天收获，四川产区在霜降前后收获；陕西延安在10月下旬或11月上旬。收获不宜过早过迟，过早，当归尚未完全成熟，会降低产量和品质，过迟，土壤冻结，根条变脆，容易折断，损失过大。一般来说，以土壤结冻前，植株黄萎时收获为宜。在收获前10～15天，先割去当归茎叶留下3厘米左右的茎桩以便收获时识别。这样能使地面晒到太阳，加速成熟。同时应防止牲畜践踏和引起烂头。收获时用锄头挖掘，先将植株下面挖空，再从上面将其挖倒取出，这样能挖全根部，也不致断伤根部。挖后结合翻地，再拣一次漏挖或挖断的根。采收后，运回加工场地捆扎，以待加工。一般亩产干当归100～150千克，丰产田亩产可达250～300千克。