为害黄花菜的主要虫害有红蜘蛛、蚜虫、蛴螬和地老虎。

红蜘蛛：危害叶片。成、幼虫及螨以刺吸式口器吸食植株的汁液，叶片被害后呈淡黄色至焦黄色，严重时发生成片枯黄。防治方法：首先于早春清除田间的枯枝落叶等杂物，消除越冬的红蜘蛛。在苗期发现红蜘蛛危害时，用20%双甲脒乳油1000～2000倍液，或73%克螨特乳油1500倍液，或50%辛硫磷乳油2000倍液进行茎叶喷雾，施药时间以上午9～10时、下午4～5时效果较好。

蚜虫：危害心叶、芽及花蕾。当虫害发生时，用40%乐果乳油2000倍液，或50%灭蚜粉乳油1000倍液，或20%速灭杀丁乳油2000～3000倍液进行茎叶喷雾。

危害黄花菜的地下害虫有蛴螬和地老虎。发现危害时，用90%晶体敌百虫800倍液、50%辛硫磷乳油1000倍液，浇灌在被害植株周围；或用90%晶体敌百虫0.5公斤对水10公斤喷于100公斤切碎的鲜草或菜叶上，在傍晚撒于株间诱杀，第2天早晨在鲜草或菜叶下面捕捉害虫，尤其对防治地老虎效果较好。

由于黄花菜的食用部位是花蕾和嫩叶，在病虫害防治过程中要禁止使用残留较高的有机氯农药和剧毒农药，在采食嫩叶和采花蕾前10天禁止喷施农药。