引起桂花鱼发病的寄生虫主要有车轮虫、鳃隐鞭虫、斜管虫、指环虫、舌杯虫、小瓜虫、孢子虫、锚头鳋、鲺和锥体虫，还有寄生在鱼口腔、鳍条的聚缩虫。

桂花鱼对敌百虫较敏感，每立方米水用0.3克便会对鱼体有害，要慎用。常用高锰酸钾、食盐、灭虫精、百虫将、敌鱼虫、鱼虫清等药物(使用方法参照说明书)。但应注意在杀灭小瓜虫时，千万不要用硫酸铜，用硫酸铜会使小瓜虫形成孢囊，进行大量繁殖，适得其反。