9）防疫：应用发酵床养猪技术，正常的免疫程序不可减少，特别是规模化养猪场尤为重要，但抗生素等药品的用量可逐步减少，减少量一般可达到50%以上，规模化猪场全部采用该项技术，正常运行半年以后，药品使用量还会锐减。
　　
　　生态环保养猪法的优点概括为：五省、四提、三无、两增、一少、零排放。五省：省水、省工、省料、省药、省电。四提：提高猪肉品质、提高生猪抵抗力、提前出栏、提高肉料比。三无：无臭味、无蝇蛆、无环境污染。两增：增加经济效益，增加生态效益。一少：减少猪肉药物残留。零排放：猪粪尿全部在猪舍内降解，没有污水和粪便向外排放。
　　
　　发酵床缺点
　　
　　发酵床真的那么好吗？我看未必。我亲身应用过，体验过，做过对比试验，试验数据结果证明，发酵床，没有能增加养猪的经济效益。应用发现，发酵床还有很多固有的缺点，特别是大规模猪场，这些缺点更是明显。
　　
　　一、饲养密度降低导致猪舍成本，用地成本增加。发酵床技术要求饲养密度降低，每头猪需占地1.5㎡，而规模化、集约化猪场保持每头猪1㎡的密度就可以。这个问题对于农户的几头，几十头猪的规模来说不是问题，但是对于大猪场，问题就不小了。大猪场，饲养密度降低，要想保持存栏量和出栏量，势必要扩大猪舍，那么就需要更多的土地。因此增加了猪舍成本，用地成本。
　　
　　二、发酵床猪舍不能完整实施消毒防疫程序。发酵床的猪舍内不能使用化学消毒药和抗生素类药物。而当前规模化养猪受到疾病的威胁越来越严重，越来越复杂，病毒的感染，细菌的继发感染，混合感染越来越严重。面对复杂的疫情，发酵床的益生菌，发酵床床体的温度能解决问题吗？？？事实证明，益生菌对抑制病毒没有什么效果。那么一旦爆发疫情，不能使用消毒剂和抗菌药，后果不堪设想。特别是规模化猪场，由于养猪规模大，密度大，实施严格的消毒程序，实施严格的生物安全措施是保证猪群安全、生产稳定的重要保障。而发酵床不让对猪舍消毒，如何是好？？？？虽然发酵床床体中心温度有50℃，对大多是细菌有一只杀灭作用，但是表面的呢？表面也就是在25℃左右，能杀灭吗？表面靠益生菌杀灭？益生菌能解决病毒吗？靠发酵床温度和益生菌来抑制和杀灭有害菌和病毒是痴人说梦吧。不要跟我说在猪舍垫料铺上塑料薄膜再消毒，这个方法很荒谬，很折腾！有猪的情况下怎么铺薄膜？薄膜的成本不算啊，这也是增加成本了啊？也不要说可以消毒，不往垫料喷消毒药就行。只消毒过道，不对猪舍内壁消毒能有多少效果？不消毒猪舍内壁，那猪舍内壁不是有很多细菌病毒繁殖了，当病菌达到一定的数量，不就很容易让猪发病了？
　　
　　三、垫料资源问题不能回避！农村散户规模小，还很容易解决垫料的资源问题，规模化猪场问题就大了。我们猪场存栏超过2万头，照这样算，每头猪占1.5㎡，（母猪也算1.5㎡/头的占地）就要超过3万㎡的猪舍，垫料按60cm厚度算，就要1.8万立方米的垫料，这么大的垫料需求，怎么解决？这个不是因地制宜就能解决的。
　　
　　四、发酵床的栏舍利用率低，不利于规模化猪场的生产需要。一般规模化猪场实施全进全出，出猪之后洗栏，消毒，干燥一周这样就可以重新进猪饲养，而发酵床呢？发酵床猪舍出猪之后，要把垫料堆积，重新发酵15天到1个月之后才能进猪。浪费是这段时间造成的经济损失你们为什么忽略了？？？？这样极大降低了猪舍的利用率，无形中造成了猪舍成本增加。
　　
　　五、发酵床养猪不能达到全进全出的效果。为什么呢？这个主要是因为发酵床猪舍在出猪之后不能洗栏，不能用化学消毒药对猪舍消毒。还有，猪舍在使用之后，由于猪的活动，在猪舍内墙壁上形成了一层污垢，这污垢主要是猪粪，猪的唾液及其他杂物。这些污垢存在有机物，肯定含有很多有害菌，病毒等等，若不能把这些污垢清洗，消毒，那么下一批猪进来之后很容易受到感染，发病。养猪人都知道全进全出的重要性，所以，想应用发酵床，想清楚再动手吧，不要被铺天盖地的宣传迷惑，否则容易出现严重后果。
　　
　　六、发酵床的温度和湿度很难控制在一个理想水平。特别是在南方夏天，发酵床猪舍很容易出现高温高湿的环境。怎么解决？装大功率风扇？装水帘降温系统？给房顶淋水？喷雾？那这些措施的成本算了吗？这样一来怎么能说发酵床节省成本呢？降温的电费成本低吗？