在蚊体内，JEV不破坏细胞，侵入2天内在脂质体的吞噬细胞或血液内增殖。病毒抗原广泛分布于许多器官中，但感染4天总会出现选择性地感染中枢神经系统；再过1~2天，能自唾液腺中发现病毒。 
            
    5.病理变化  

    患病猪脑和脊髓膜充血，脑室和脊髓腔液增多。公猪睾丸不同程度肿大，睾丸实质充血、出血和出现坏死灶。子宫内膜充血、出血和有粘液。流产或早产胎儿脑水肿，皮下血样浸润，肌肉似水煮样，腹水增多，胸腔积液，浆膜出血。木乃伊胎儿从拇指大到正常大小，肝、脾、肾有坏死灶。 

    6.诊断 

    根据流行病学、发病症状、病理变化，可作出初步诊断。进一步确诊需要作病毒分离(小白鼠脑内或鸡胚卵黄囊内接种)和血清学诊断(中和试验、血凝抑制试验)。当母猪发生繁殖障碍时，须与布氏杆菌病、伪狂犬病、猪细小病毒病等进行鉴别诊断。 

    7.预防

    在人类中用人重组干扰素?Ａ治疗JE临诊效果很好，但对猪是不适用的，切实可行的办法是切断感染环节。然而JEV可在多种蚊体内增殖，感染模式随当地生态环境而变化，控制蚊是不现实的。为此用JEV疫苗免疫种猪群已被广泛应用，作为预防和控制的有效措施。 
  
    有多种减毒疫苗在实际使用中效果都很良好。灭活疫苗效果较差，使用不普遍。建议对初产母猪和公猪在蚊活动季节开始前用减毒疫苗接种２次，间隔２～３周。为格外小心起见，建议在蚊活动季节中，对种猪在配种前再接种。此疫苗可与其他病毒疫苗如猪瘟同时接种。 

    8.治疗

    无治疗方法，一旦确诊最好淘汰。驱灭蚊虫，注意消灭越冬蚊。对病猪要早发现、早隔离。猪圈及用具要消毒。死胎、胎盘和阴道分泌物都必须妥善处理。流行地区，定期注射猪乙脑疫苗，提高猪的抗病能力。一般对后备公母猪在本病流行期前一个月注射猪乙型脑炎弱毒疫苗免疫，第二年加强一次，免疫期可达3年。