（１）选育自然免疫的鱼类新品种：在鱼类养殖过程中，可以见到一些发病严重的鱼池，在部分鱼因病死亡的情况下，少数鱼能安然无恙地生存下来，这些生存下来的鱼，可能由于本身有较高的抗病能力，或鱼体内产生了某种抗体，对病原体有免疫作用。如我国池养的草鱼、青鱼患出血病、肠炎病、赤皮病后亦发现有抗体生成。根据鱼类病后可得免疫性的原理，我们可将病后生存下来的鱼专池饲养起来，系统地观察其个体和子代是否对某些病原具有免疫力，有目的地去选育抗病力强的鱼类品种。 
　　
　　（２）利用原系亲鱼繁殖，避免近亲繁殖引起种质退化：自人工繁殖成功以来，很多繁殖场采用的亲鱼都是自己池塘里培育的子一代，近亲繁殖，以致鱼类种质退化，抗病力下降，鱼病连年暴发。实践证明，采用天然水系亲鱼繁殖的后代，具有抗病力强、疾病少、生长快的特点。长江水系亲鱼繁殖的后代即如是。亦可采用不同水系亲鱼交配繁殖后代，同样有提高抗病力的效果。 
　　
　　（３）种间杂交培育抗病新品种：利用免疫的遗传性原理，采用鱼类种间杂交，培育抗病力强的新品种。例如我国有些单位，采用草鱼和团头鲂的杂交品种――鲩鲂，就具有抗病力强的特点。虽然这种鲩鲂生长比草鱼慢，但不易得病死亡，在产量上有保障，如适当增加其放养数量，可弥补其生长慢的缺点。又如鲤鲫杂交种的抗病力也比鲤强得多。因此，在品种改良上应考虑抗病新品种的培养。 
　　
　　（４）人工注射、喷雾、口服或浸泡疫苗，使鱼获得免疫力，例如我国草鱼出血病和赤皮、烂鳃、肠炎病免疫防病，使草鱼成活率大大提高。