3.1提高外源基因转化率并建立高频再生体系

　　目前虽然已获得了许多转基因油菜植株，但大部分都是经过了大量的重复实验后仅得到的几个转化体克隆。一些转化受体如小孢子、叶绿体等的转化率一般在1％以下。另外一些转化方法如基因枪法、激光微束穿刺法、真空渗入法等，其转化率也很低，均达不到直接为生产服务的要求。因此，对现有的外源基因转化方法作一些改进或建立新的基因转化方法，提高转化率，建立高效的基因转化系统仍然是有待解决的问题。

　　3．2提高对转基因油菜中外源基因的表达的调控及其遗传稳定性

　　目前在油菜的遗传转化中，外源基因的插入整合基本上是随机的，其表达水平、表达的部位及时问也大多不受控制，因此对外源基因的表达调控基本上处于失控状态。另外，还有由于外源基因的随机插入及拷贝数高而引起转基因沉默现象。解决这些问题就需要深入研究植物的生长发育机理、采用特定的启动子、使用植物偏好密码子、研究及应用定点插入技术等方法。

　　3.3与传统常规育种相结合

　　利用基因工程方法获得的油菜转基因植株只是一种人工种质新材料，要使其成为生产上可以应用的新品种就必须经过常规育种程序的考验。转基因植株须经大田试验将外源基因持续遗传给后代，建立遗传稳定的品系，才可能最终取得经济效益和社会效益。而在现在的油菜转基因研究中，许多转基因植株未能保存，或不能通过种子将外源基因的性状遗传给子代，而且采用的大部分基因为报告基因，没有生产应用价值。

　　3.4转基因油菜的安全性问题

　　随着基因工程研究的进展，许多转基因农作物也进入了实用化、商品化阶段，而其安全性问题，也引起了广泛的争论，并且受到了各国政府的高度重视，转基因油菜也不例外地存在安全性问题。转基因油菜中的外源基因可来自植物、动物或微生物，一些基因虽已经过严格的安全性试验后才被允许进入商业化生产，但人们对转基因油菜仍然心存疑虑。但勿容质疑转基因油菜是油菜科学研究和生产的一场革命。现存的问题将是推动转基因油菜研究走向更加成熟、完善的动力，而不是阻力。