万寿菊幼苗易感染猝倒病，要注意土壤消毒，发现病情立即喷洒1000倍甲基托布津或75%百菌清600倍液加以防治。潜叶蝇对万寿菊的侵害非常大，在刚出现危害时喷药防治幼虫，可用40%乐果乳油1000倍液、50%敌敌畏乳油800倍液，防治幼虫要连续喷药2～3次；红蜘蛛的侵害也是万寿菊夏季时的主要虫害，可喷施1500倍40%乐果乳油进行防治。开花期，易遭到鼠害，在初花期，用蔬菜茎、叶拌毒药放在大田四周及鼠洞附近，进行早期防治。