花鲈病毒性疾病目前尚无有效的药物治疗方法，控制措施主要在于生态预防。

具体措施为：

第一、加强检疫工作，在鱼被引入新区前，应进行严格的检疫，限制把疫区的鱼运到非疫区，切断疾病传播途径。
第二、不用带病毒的亲鱼采精、采卵，培育健壮苗种。
第三、放养健壮苗种，根据鱼体生长情况及时分箱，保持合适的放养密度。苗种入箱和分箱时都应进行体表消毒，同时拌饲投喂抗菌素。
第四、注意预防寄生虫病和细菌性疾病，在发病季节尽量避免生产操作造成的鱼体体表损伤。依发病季节和规律定期预防用药。
第五、一旦发现网箱内有病鱼时要采取隔离措施，彻底捞除病鱼、死鱼消毁，并施药防止细菌和病毒的继发感染。
第六、加强养殖管理，养殖设施和工具应彻底消毒。
第七、鱼饲料必须新鲜、营养丰富、适口性强。做好定质、定量、定位、定时的“四定”投饲。
第八、注意养殖水域环境卫生，增强防病意识。
第九、尽快搞清病原，加强人工免疫防治研究。