肥料之间有“相生”关系，也有“相克”矛盾。比如多施磷肥，多余的有效磷与土壤中的有效锌结合形成难溶性的磷酸锌沉淀，而引起土壤有效锌的缺乏。不仅如此，多余的有效磷还会抑制作物对氮的吸收，引起氮的缺乏。又比如多施钾肥，多余的钾会减少作物对氮、镁、钙、硼和锌的吸收，引起农作物体内缺乏这些营养元素。即使是有机肥也不可过多施用。如果施用过多，土壤中微生物与农作物会出现“争氮”“夺氮”的矛盾，引起土壤一段时间内暂时缺氮，而且多余的有机质与锌形成络合物或螯合物，会降低锌的有效性。要防止肥料之间“相克”，可采取以下方法： 
　　尽可能做到平衡施肥 目前仍有一些农户对农作物偏施或多施单质肥料，不仅浪费了肥料，增加了生产成本，而且导致其他某种或某些营养元素的缺乏。施肥时要根据农作物需肥结构的不同和土壤的供肥能力，做到量出为入，不偏不少，力求营养元素之间的平衡，这样就可以相安无事。另外，还要根据不同作物对各种营养元素的需求比例关系，要增同增，要减同减。相对单质肥料而言，复合肥或复混肥营养元素的比例关系比较适当和协调。因此，施肥时应以复合肥为主，以单质肥料为辅，如对于以块茎、块根为收获对象的蔬菜等需钾量大的农作物，可在施用硫基复合肥的基础上，再适当增加硫酸钾单质肥料作补充。 
　　错开施用时期或施用部位 锌肥和磷肥若混施必然会产生 “相克”。因此磷肥应作底肥或基肥施用，锌肥应作追肥施用。氮、磷、钾等大量元素肥料应以根际追肥为主，微肥应采取叶面喷施的方法。 
　　缩小接触范围 氮、钾肥可采用撒施的方法，磷肥可采用集中施肥的方法，微肥可采用拌种、浸种、蘸根等方法，使微量元素局限在根部这一较小的范围内，尽量不与大量元素接触。