甘草病害主要有甘草褐斑病、锈病等，在播种时最好进行药剂拌种，一般用可湿性多菌灵、甲基托布津等药剂处理种子，按种子用量的0.5%～1%有效浓度拌种，拌药后堆闷1～2h即可播种。也可用50%的多菌灵处理土壤；若甘草发生锈病、褐斑病，可以部分拔除甘草病株深埋在甘草地外；还可用20%萎锈灵乳油或95%敌锈钠液连续喷两次防治锈病，用70%甲基托布津喷洒防治褐斑病。