1．萌发菌的种类
　　
　　现已报道的天麻种子萌发菌均属口蘑科、小菇属的4种真菌，它们的名称是：一是紫萁小菇；二是兰花小菇；三是石斛小菇；四是开唇兰小菇。1999年，我们分离、培养出另一类天麻种子萌发的真菌，为多孔科的大白栓菌。此菌在较高温季节生产和应用要优于上述四种菌类。
　　
　　2．萌发菌的制作技术
　　
　　萌发菌母种的分离与培养：在天麻的栽培场地和野生产区很容易采到蜜环菌子实体。但很不易采到萌发菌的子实体。目前分离萌发菌种只有两种较好的方法。一是采取紫萁小菇、石斛小菇、大白栓菌等子实体，用子实体的组织或孢子分离法获得菌种。萌发菌的孢子分离法与蜜环菌种的孢子分离法完全相同。二是用天麻种子形成的原球茎作分离材料。但从原球茎上分离获得的菌种，一定要进行生产试验后才能用于生产。这是因为帮助天麻种子萌发的真菌，现已知道不只是一属或一科的几个种类，而是多个属、科的多个种类。而且有些种类真菌的菌丝体对促进天麻种子萌发的效果较差。所以，建议要从科研单位或正规的菌种厂家购买萌发菌母种或原种用于扩大生产。
　　
　　栽培种配方：现在生产中应用的萌发菌栽培种大多是用阔叶树落叶配制的。有两种生产方法，一是将树叶粉碎后配制，二是用完整的树叶配制的。无论是用碎叶，还是整叶，均要将其放入清水中浸泡3～4小时后，捞出沥去浮水，再撒入麸皮20％，石膏1％，蔗糖1％。拌和均匀后即可装瓶或塑料袋、灭菌、接种。也有用锯木屑、棉籽壳配制萌发菌栽培种的。
　　
　　3．萌发菌与天麻种子伴播技术
　　
　　播种前将已培养好的萌发菌栽培种，由培养瓶或是塑料袋中掏出，放在洗脸盆或塑料盆中，每平方米用菌种2瓶，如是树叶菌种，要将粘在一起的菌叶一片片分开备用；如是锯木屑、棉籽壳菌种，要将菌种捏成小颗粒状备用。
　　
　　将天麻种子由果实中抖出，轻轻撒在菌叶上，边撒边拌，种子应分多次撒播，撒后拌均再撒，以免种子集中粘在几片叶子上，影响发芽和接菌效果。撒种与拌种工作应两人分工合作，一人专撒播种子，一人用手专把种子拌均在菌叶中。撒播天麻种子时，应在室内和背风处进行，防止风吹丢失种子。最好的撒播方法是选择一大小适中的玻璃瓶，将要撒播的果实和种子捏碎放入瓶中，用小针在塑料上扎些大小、距离适宜的小孔筛，然后把塑料小孔筛用橡皮筋或线索扎在瓶口，再倒过来缓缓把天麻种子分三至四次筛入萌发菌叶中。
　　
　　将天麻种子与萌发菌叶充分拌均匀后，就可以与事先发好的蜜环菌材或菌枝进行穴播或是箱播了。