腹泻可发生于各个年龄的猪，但是主要发生在三个年龄段：1～3日龄新生仔猪，7～14日龄新生后期仔猪和断奶后仔猪。新生后期仔猪腹泻发生率似乎有所增加，特别是集约化分娩管理的猪场。

虽然仔猪腹泻的病原很多，而且复杂，但其主要原因是仔猪接触病原体的机会增加的同时，母源抗体水平下降，当多种传染性病原体超过初乳和乳原性免疫保护能力时，仔猪发生下痢。产房温度、湿度、通风、卫生等环境因素对腹泻的严重程度和病畜的存活率具有重大影响。　

最常见的腹泻病原体是大肠埃希氏菌、轮状病毒、传染性胃肠炎病毒和猪等孢球虫。