一、病害主要是绿霉、青霉、毛霉等杂菌感染，发生严重时，能抑制蜜环菌的生长，也能浸染天麻块茎造成腐烂。防治方法：①选择排水良好的地块栽植；②选用优质菌材；③栽培过程中控温保湿；④菌材间隙用腐殖土或稻谷填实。

二、虫害主要有蛴螬、蝼蛄、金叶虫、白蚁、老鼠以及畜禽糟踏等。防治方法：①灯光诱杀；②用90%敌百虫1000倍或50%辛硫磷1000倍液浇灌；③用90%敌百虫25克加适量水化解后拌炒麦麸5公斤，加适量水配成毒饵，于傍晚置畦面诱杀；④老鼠可用夹子捕杀或毒饵诱杀；⑤加强畜禽管理。