蘑菇出现红根菇是生理病害。主要原因在于出菇后气温低、蒸发少、菌丝生活力弱、吸水能力差、出菇慢、喷水过多、相对湿度太大，或是气候突然变化刺激、通风不良、培养料偏酸、喷施葡萄糖过多(肥害)等在素。

预防措施：根据蘑菇子实体和菌丝长势及天气状况用水。注意避开低温时间喷水、通风，覆土的含水量一般应在18％一22％之间，如培养料偏酸，可喷施3％的石灰水澄清液缓解。