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1.母猪原因
母猪的乳汁质量不好，过浓或过稀或受感染后乳中带菌。另外母猪粪便中含有大量的大肠杆菌而导致仔猪接触后受感染。
2.细菌原因
大肠杆菌、沙门氏菌以及C型魏氏梭菌素都可引起仔猪腹泻的发
生，可用抗生素治疗。
3.病毒原因
轮状病毒和冠状病毒可导致腹泻，但无有效药物治疗，抗生素只能防止继发感染。
4.营养性原因
植物性饲料如其中含的豆粕可使仔猪肠道致敏。如果乳猪料中豆粕用量过大，势必加剧肠道过敏而引起腹泻，这就是为什么有些乳猪料粗蛋白含量低，但腹泻发生率低。但粗蛋白含量低（18％）的乳猪料不能满足乳猪断奶后快速生长发育的需求。所以乳猪料中应含有除豆粕外的优质蛋白质原料。另外要争取早日补料，让消化道适应植物性饲料的变化。
5.环境原因
产仔舍内卫生条件差，潮湿、温度变化大，小环境条件恶劣等也可引起仔猪腹泻的发生。
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