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1.进行经常性消毒，杀死环境中存在的病原微生物。常用的消毒药有过氧乙酸，火碱，新洁尔灭等。
2.哺乳母猪应喂优质饲料，产房应卫生、干燥、保温、空气清新，避免贼风侵入，以免仔猪受凉引起腹泻。
3.妊娠母猪产前注射疫苗，使新生仔猪被动产生免疫。
4.在猪腹泻病多发地区，仔猪出生后要注射疫苗。给猪注射传染性胃肠炎与猪流行性腹泻二联灭活苗时，应在后海穴位注射，注射深度根据猪的大小在0.5～4厘米之间。
5.坚持"自繁自养"原则，不从疫区购入猪只，以免传入疫病。
6.给出生后3～4日龄的仔猪补铁，可有效降低腹泻发生率。