玉米秸杆还田的方式主要有直接还田和间接还田。随着机械化收获和秸杆粉碎机械作业的推广，玉米秸杆直接还田的面积逐步扩大：
  1、秸杆粉碎覆盖还田。在玉米收获时用联合收割机或用秸杆粉碎机械将收获后的秸杆就地粉碎并均匀抛撒在地表覆盖还田，用免耕播种机直接进行下茬作物播种。秸杆粉碎要细碎均匀，长度不大于10厘米、铺撒均匀，留茬高度小于15厘米。
  2、秸杆粉碎后翻埋还田。用犁耕翻埋还田时，耕深不小于20厘米；旋耕翻埋时，耕深不小于15厘米，耕后粑透、镇实、整平，消除因秸杆造成的土壤架空，为播种和作物生长创造条件。
秸杆还田的地可按还田干秸杆量的0.5%~1%增施氮肥，调节C/N。