提高孵化率及雏鸡的质量，孵化过程中的每个环节都不容忽视，种蛋的选择及消毒是重要的两个环节。
种蛋的选择问题，种蛋的质量对小鸡的孵化起着主要的作用，在同等孵化条件下，种蛋的质量高孵化率就高，种蛋的质量低孵化率就低，认真选择好种蛋，是小鸡孵化成功的第一步。小鸡种蛋必须来自健康、营养好、公母比例适当的种群，小鸡种蛋过大、过小、过圆、过长、凸腰、凹腰、两头尖、沙壳蛋、皱纹蛋均不适合做种蛋。
种蛋的消毒，禽蛋产入蛋窝时，蛋壳表面会沾染上很多细菌和病毒，这些细菌和病毒在适宜的条件下大量繁殖。种蛋受到污染不仅影响其自身的孵化，而且污染孵化设备，传播各种疾病。种蛋消毒的原则,一要对实行消毒的工作人员无害，二要不损伤种蛋胚胎，三杀灭细菌和病毒要干净彻底，种蛋的消毒方法有甲醛熏蒸消毒法、新洁尔灭喷雾消毒法。