研究发现扬子鳄的代谢率在个体间差异很大，它与扬子鳄的个体状态、大小、驯化程度都有一定的关系。

当环境温度低于10℃时，鳄的代谢率极低，此温度范围相当于扬子鳄分布区的12月份到翌年的2月份，扬子鳄进人冬眠麻痹状态；当环境温度低于20℃~21℃时，鳄的代谢率开始迅速降低，此温度范围相当于扬子鳄分布区的9月下旬以后到翌年的5月中旬之前，这时扬子鳄的活动性能很低，人工投喂饲料，鳄很少采食；当环境温度上升到25℃以上时，鳄的代谢率迅速上升，此温度范围相当于扬子鳄分布区的6月中旬之后的气温，鳄出现交配行为，活动性显著增强，接受人工投喂的饲料，但吃食的软量仅为高温期所需要数量的1/2；当环境温度上升到28℃以上，此温度相当于分布区7月中旬到9月中旬，此时是鳄卵孵化期，也是鳄食欲最旺盛时期，人工投喂饲料量要比6月中句增加1倍。

扬子鳄这种活动性的季节变化与环境温度和代谢率之间的这种密切关系，乃是长期自然选择的结果。