蔬菜病害大多通过种子传播、真菌、细菌、菌丝体、分生孢子、病毒潜伏在种子内外，菌核混杂在种子中。种子消毒可杀灭细菌，使病毒失去活性，有效防止病害发生，并可提高种子发芽率和发芽势，增强幼苗抗性。种子消毒是最重要、最有效、最方便、最经济的蔬菜病害防治措施之一。
 　　一、真菌类病害的种子消毒法
 　　　　1.温汤浸种　因蔬菜种类不同，其水温和浸种时间各异。瓜类、茄果类种子用55℃温水浸种15分钟～20分钟。芹菜种子用48℃温水浸种30分钟。菜豆种子用45℃温水浸种10分钟。大葱、洋葱种子用50℃温水浸种25分钟。
 　　　　2.药剂浸种　　①40%甲醛(福尔马林)100倍液浸种30分钟。　　②50%多菌灵500倍液浸种1小时。　　③72%普力克水剂800倍液浸种30分钟。　　④50%代森铵500倍液浸种1小时。　　⑤36%多硫悬浮剂500倍液浸种24小时。　　⑥咪唑盐酸500倍液浸种1小时。　　⑦番茄早疫病种子经浸泡3小时～4小时后，移入0.3%～0.4%硫酸铜溶液中浸种5分钟；辣椒疫病、炭疽病用1%硫酸铜溶液浸种30分钟。　　⑧黄瓜枯萎病用2%～3%漂白粉溶液浸种30分钟～60分钟。　　⑨菜豆枯萎病用60%防霉宝超微粉剂600倍液浸种30分钟。　　(10)大葱、洋葱紫斑病用0.1%～0.2%高锰酸钾溶液浸种20分钟；瓜类枯萎病用0.1%～0.2%高锰酸钾溶液浸种30分钟～60分钟。　　(11)黄瓜菌核病用10%食盐水搓洗清除菌核。
 　　　　3.药剂拌种　　①黄瓜疫病，白菜、萝卜、菠菜霜霉病，用种子重量0.3%的50%福美双可湿性粉剂拌种。　　②黄瓜黑腥病，用种子重量0.3%的50%多菌灵可湿性粉剂拌种。　　③菠菜霜霉病，用种子重量0.3%～0.4%的25%甲霜灵可湿性粉剂拌种。　　④瓜类真菌病，可用种子重量0.4%～0.5%的绿亨2号可湿性粉剂拌种。　　⑤白菜黑斑病，用种子重量0.2%～0.3%的扑海因或50%速克灵拌种。 　
　　　二、细菌性病害的种子消毒法 
　　　　1.温汤浸种　瓜类种子用55℃温水浸种20分钟。甘蓝、花椰菜、萝卜种子用50℃温水浸种20分钟。菜豆种子用45℃温水浸种15分钟。辣椒种子用55℃温水浸种30分钟。
 　　　　2.药剂浸种 　　①黄瓜、甘蓝、花椰菜种子用72%农用链霉素1000倍液浸种2小时。　　②菜豆种子用硫酸链霉素500倍液浸种24小时。　　③辣椒种子用1%硫酸铜溶液浸种5分钟。　　④萝卜种子用45%代森锌水剂1000倍液浸种15分钟～20分钟；还可用75%农用链霉素1000倍液浸种2小时。
         3.药剂拌种 　　①黄瓜、甘蓝、花椰菜、萝卜种子用种子重量0.4%的50%福美双可湿性粉剂拌种；萝卜种子还可用种子重量0.3%的35%甲霜灵拌种剂拌种。　　②辣椒种子用种子重量0.3%的50%敌克松原粉拌种。　　③菜豆细菌性疫病用种子重量0.3%的50%福美双可湿性粉剂或70%敌克松原粉拌种。
　　三、病毒病的种子消毒法
 　　　　1.温汤浸种　用60℃～62℃的温水浸种10分钟。
 　　　　2.药剂浸种　用10%磷酸三钠溶液浸种20分钟。
 　　　　3.干燥处理　将种子置于70℃干热条件下(如恒温干燥箱)处理72小时。
 　　　　四、注意事项
 　　　　1.温汤浸种时要不断搅拌，使种子受热均匀。同时根据不同水温的要求，不断加入热水，保证在规定时间内维持所需温度，不可降低水温。药剂拌种要均匀，使每粒种子都沾有农药。
 　　　　2.温汤浸种后的种子，可按不同蔬菜种子对浸种时间的需要，在冷却的水中继续浸种，也可取出催芽播种，或晾干后直接播种。
 　　　　3.药剂浸种、拌种，其浓度、药量必须按标准要求，浓度不可超高，药量不可增加。
 　　　　4.药剂浸种后，要用清水冲洗种子，除去种子上的农药，以免播种后产生药害，影响种子发芽和幼苗生长。