黄耀祥被称为“半矮秆水稻之父”，他于20世纪50年代主持的“水稻矮化育种”获得成功，育成第一个半矮秆籼稻品种“广场矮”。

　　针对上世纪50年代中期水稻倒伏问题，黄耀祥开展了以矮秆为主体的水稻遗传学、生理学、生态学基础与矮秆品种优良性状的关系、创造理想株型与光合作用的关系等进行了较系统的研究，先后开创了“矮化育种”“丛化育种”“半矮秆早长超高产育种”“半矮秆早长超高产特优质育种”“半矮秆早长根深超级稻育种”等生态育种理论，加快了育种进程的“组群筛选”育种方法，是我国目前开展的超级稻育种的奠基人之一，至1999年育成“广场矮”“珍珠矮”“广陆矮4号”“双桂1号”“双桂36”“桂朝2号”“特青2号”“胜优2号”“七山占”“七秀占”“胜泰1号”等一大批著名高产优质良种，在我国南方稻区大面积推广应用，为提高我国各个历史时期的水稻产量作出了重要贡献。育成推广面积较大的品种有60多个，其中面积超过1000万亩以上的有15个品种。育成的品种累计推广面积超8亿亩，增产稻谷845亿公斤，增加产值845亿元，成为农科效益之最。