安徽皖垦种业为农垦集团公司控股，中国种子集团公司、安徽国元控股（集团）公司、上海禹杉股权投资中心、安徽省国有资产运营公司参股的股份制公司。是农业部发证的“育繁推一体化”企业，先后荣获中国种业骨干企业、中国种业AAA级信用企业、省农业产业化龙头企业、省第一批创新型企业、省诚信种子企业、农发行黄金客户和AAA级信用企业等称号。“皖垦”商标被评为安徽省著名商标、皖垦种子产品连续多年被评为省名牌农产品。皖垦种业小麦种子生产经营量在全国位于前列，2011年销售额逾3亿元。皖垦种业注册资本1.5亿元，总资产逾3亿元；拥有13家分公司、1家控股公司和2家参股公司，具有完备的种子生产、加工、检验、仓储设施和健全高效的种子质量管理体系，集科研、生产、加工、销售于一体。

　　皖垦种业科研人员占公司总人数的30%以上，以“安徽皖垦生物工程研究院”为科研平台，创建了“一院六所十一站”的“1611”三级科研体系。在小麦等作物科研上形成了审定品种不断推出、接力品种排队等候、后续品系源源不断的格局。皖垦种业自育品种及产权品种近30个。2011年，皖垦种业有51个品系进入国家和省试验。

　　皖垦种业全国唯一的种业试点单位被农业部确定为全国首个实施种子质量追溯系统项目的建设单位。在种子质量管控中，实现了生产可记录、信息可查询、流向可跟踪、责任可追究。

　　皖垦种业种子年推广面积超过1500万亩，取得了良好的经济和社会效益。通过良种补贴政府招标等活动，经测算，为农户节本2.5亿元，种子在生产上增收5亿元以上。