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在防控鸡法氏囊病的实践中，人们应当形成这样的认识：即疫苗免疫是最简明有效的方法，而免疫的成功与否很大程度上是取决于对疫苗的选择和使用，而对疫苗的选择和使用又在很大程度上依托于对雏鸡体内抗体水平的估计与免疫时间的确定。
疫苗的种类
1、活疫苗；
IBD活疫苗有温和型，中等毒力型 ，和强毒型三种。温和型疫苗毒力弱，接种后对法氏囊没有损害，但接种后抗体上升较慢，抗体效价也相对较低；中等毒力疫苗，毒力中等，接种后对法氏囊容易造成损害，特别是母源抗体较低时的雏鸡，而强毒型的法氏疫苗，很容易造成法氏损害，无母源抗体时，无异于人工攻毒，故生产上较少使用，而通常以使用中等毒疫苗为多。
2、油乳剂灭活疫苗
一般油乳剂 灭活疫苗通常是以活疫苗为免疫基础，用于加强免疫，它对于幼龄鸡免疫原性较差，它的特点是虽然产生抗体较慢，但产生的抗体高而持久，一般用于产蛋种鸡较多。
免疫程序
同新城疫等疾病一样，法氏囊病的免疫程序不是一成不变的，应根据本地区该病的流行状况，鸡群的种类，病苗毒株的特点，鸡群母源抗体的状况及饲养管理条件等来综合制定，没有一种免疫程序适合于任何场。
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