由于绿毛龟饲养条件相对优越，故很少生病。其常发生的疾病是绿毛衰败症，主要表现为绿毛（藻）由墨绿色逐渐褪为淡绿、黄绿色，直至发黑，严重的萎缩脱落，龟壳上留下灰白色石状物。该病由水质严重偏酸、偏碱或水中含氯未除尽引起。
　　一旦见绿毛龟毛（藻）色变化时，首先洗去断毛、变色毛，然后换入新水，这样经过一段时间调养，病龟就会好转。