在采种前要选定留种田，选择品种纯正、生长健壮、病虫害轻、很少有抽苔开花植株的丰产田块留种，等地上部全部枯死时采收。采后挑选球茎符合本品种特征、个头较大、较重、顶芽比较弯曲的球茎做种。由于顶芽弯曲才有利于积累养分，不易萌发。选留的种球要掰下顶芽，并稍带一部分球茎上部，即将慈菇顶芽倒入，浸泡在50%多菌灵600倍液中消毒20-25分钟，捞出沥干余水，摊成薄层晾干，然后贮藏过冬。每100千克球茎，大约可掰取顶芽12-15千克，可供种植1亩大田之用。