番荔枝根朽病指由 Ganoderma applanatum(树舌)、Ganoderma lucidum(灵芝)、Rigidoporus microporus、Fomitella supina等担子菌类引起的病害,在台东地区也经常可见,由于尚未全面调查,其分布范围及发生比率还不清楚,但以太麻里、华源地区较为常见。病菌可自根部侵入感染,导致根部腐朽,病菌逐渐往主干蔓延;也可自地际部主干侵入感染,而后往根、茎扩展。主干受感染后,木质部组织变成黑褐色,最后腐朽并转成近白色,罹病后期,植株的地际部会长出土黄或黄褐色子实体(菇体)。这类病害也导致植株黄化、衰弱终而枯死,地上部病征类似褐根立枯病,但罹病根部或地际部的病征与褐根立枯病不同,被害根通常不黏附土块、石粒,有时可见其上附着菌丝,但为灰白色或土黄色。根朽病的发生生态及防治策略与褐根立枯病相似。
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