作物在生长发育过程中，会分泌出一定的分泌物并散发出气味，而黄瓜和番茄的分泌物及其气味有互相抑制对方生长发育的作用。二者如果同棚邻作栽培，其生长势都将受到抑制。且黄瓜和西红柿都有可能遭受蚜虫的危害，一旦一方发生蚜虫，就会很快地蔓延到另一方，很难有效地控制，使二者同时受害，从而扩大危害损失。另外，黄瓜和西红柿在生长发育过程中所需的温度和湿度不同，因此在管理上很难做到二者兼顾，往往是顾此失彼，使经济效益受到影响。