防根部病害。随着外界气温降低，加上闭棚后空间相对密闭，棚内空气流通减少，湿度增大，一些生长势弱、抗性差的番茄植株受到根腐或茎基腐等病害侵染，导致吸水不足，出现萎蔫。可采用10%世高水分散粒剂＋3%中生菌素可湿性粉剂+护树大将军灌根或者淋喷。7-10天一次，连用2-3次。
 
    通风透光并控水，如果在入冬前对番茄管理不当，肥水偏多偏大，通风不及时，加上植株负载量大，会诱发萎蔫。应从管理上入手，不要急于用药。上午早通风，调控中午前后棚温不超过28°C，并适当控水，诱导根系向下向深处扎，借助胁迫作用，促进根群稳固，并有意识提高地温。
 
    雨雪过后棚内管理，雨雪天气过后，叶子一下子无法适应强光辐射，会出现萎蔫。建议采用膜下灌小水，或者连续3-5天上午11：00-下午3:00落苫一半或落花帘，以避开强光高温时段，让番茄逐步适应开棚环境。
 
    虫害防治。当出现棉铃虫等虫害时应人工剪去受虫害部位，杀死虫体，重新培养新头。如为害较轻，可用氯虫苯甲酰胺+新高脂膜以提高药效，杀灭害虫。