防治稻瘟病等病害以预防为主。应用枯草芽孢杆菌、春雷霉素等生物制剂防治对稻瘟病、纹枯病等病害进行防治，稻瘟病等防治效果在85%以上。
　　叶瘟发病初期喷施1次，过7天后可视病情再喷施1次。穗颈瘟在水稻破口期和齐穗期各喷施一次。每亩喷施枯草芽孢杆菌（1000亿芽孢／克）15～20克兑水后均匀喷施或2%春雷霉素水剂100～150毫升稀释500倍液喷雾。
　　水稻纹枯病也可采用井冈霉素防治。每公顷用5％井冈霉素可湿性粉剂2.25千克或5％的井冈霉素水剂2250～3000毫升。