由我国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,项目组日前获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。
白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目于去年9月启动,吸引了中国农科院、华中农业大学、湖南大学等多所国内研究机构以及韩、英、加、澳、美等国的相关研究机构科研人员参与,其中中国农科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所为项目主持单位。
油菜、白菜和甘蓝同属于芸薹属作物,油菜是由白菜和甘蓝杂交后进化而来。其中白菜的基因组命名为A,甘蓝的基因组命名为C,而油菜的基因组为AC。在测序技术路线上本项目采用了通量更高的新一代测序技术和全基因组鸟枪法测序策略,从而提高了测序效率。
研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿个、6.5亿个和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万个和4.5万个,油菜基因覆盖度为85%以上。
中国农科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所表示,对白菜、甘蓝和油菜进行全基因组测序是国际上首次对三个近缘作物物种进行的整体测序,其中油菜是迄今首个全基因组测序的异源四倍体植物,这不仅对研究作物进化和遗传改良有着重大意义,也对其他多倍体物种的全基因组测序具有重要的参考价值。
由于项目进展顺利,在今年8月加拿大萨斯卡通召开的国际白菜基因组测序联盟会议上,各成员国一致同意以我国的测序结果为标准序列,并将各自的数据整合到我国的白菜基因组图谱中。
项目组介绍,下一步的工作将是绘制甘蓝和油菜的基因组精细图。