针对马铃薯营养需求的特点，在生产中推荐施肥时，首先要了解当地土壤库对所需各种养分的供应量，并考虑同一土壤对氮、磷、钾不同养分的供应能力和水平是有差异的，在土壤供应量的基础上，再分别估算出氮磷钾肥的推荐施用量。以钾肥为例，南方土壤有效钾含量低，应将钾肥施用量普遍提高一些，北方土壤有效钾含量比南方高，但针对马铃薯需钾多的特点，也要适量补充钾肥。为此分别建议氮磷钾化肥的适宜比例，北方地区平均为1∶0.5∶0.6；南方地区平均为1∶0.4∶0.8。另外，对北方不同产量水平要分别推荐，假设马铃薯亩产水平在1500千克左右，推荐氮肥施用量折纯氮10～12千克/亩、钾肥用量折纯5～8千克/亩、磷肥用量折纯3～5千克/亩。

基肥最好将有机肥与化肥配合施用，才有利于结薯。一般基肥中只分配50%的氮肥、全部的磷肥和大部分的钾肥。追肥是氮钾肥，将一半的氮钾或多半氮、少半钾做追肥，可选含磷钾较高（如 12%～15%）含氮适当（约10%）的复混肥料，也可以采用单质化肥配合用。单质磷肥最好是普钙，南方酸性土地区也可选钙镁磷肥。磷肥的分配原则是，大部分在起垄前按条或穴状深施于垄底，少部分磷肥种薯块时，施于斜下方。作追施的氮钾肥要到植株顶端现蕾期进行追施，施于垄侧并随即覆土浇水。追肥时间最好在薯块进入膨大期进行，过早追肥尤其偏追大量氮肥，会引起地上部旺长地下部结小薯块的问题。基肥在种植前沟施或穴施，深度要求15～20厘米左右。追肥在行间或垅侧条施或穴施；肥料埋深5～8厘米，施肥后可以灌水并覆土。

很注意氮肥的施用，而忽视磷钾等养分的平衡，无论在基肥和追肥中，氮肥的施用量都过高。有时偏施氮肥导致地上部薯秧疯长，而地下部薯块很小的不良后果。也有不少农户已经初步掌握了相关技术。例如在甘肃和内蒙地区的部分马铃薯生产户，以有机肥为主适量配加低浓度复合肥作基肥，然后到植株顶端现蕾期，再追施适量氮肥的施肥法，所获效果不错，体现了依据马铃薯的营养特点和对氮磷钾养分的需求比例进行全程平衡施肥的可行技术。

此外，马铃薯对微量元素硼、锌比较敏感，可以通过苗床施肥和根外追肥等施肥方式加以适量补充供应，以求获得高产优质的满意结果。