美国各州的肥料管理机构均设在州农业厅，负责本州的肥料立法、肥料执法和养分管理。具体工作内容包括向生产和销售肥料的企业发放执照、肥料产品登记、肥料产品监督、信息发布、肥料样品检测、施肥技术研究与推广。

除按本州的肥料法规定开展肥料产品登记工作外，农业厅每年都制订肥料抽检计划，并聘用肥料检查员按计划对全州的肥料产品进行抽检，每一个登记的产品，每年至少要被抽检1次。各州肥料检查员的人数从几人到十几人不等，每天抽检的企业由检查员自己确定，事先不能通知被抽检单位。采样地点可以是坐产企业的仓库，也可以是销售商仓库和农户的仓库。抽检结果由州农业厅定期对外公布，每年至少要公布1次。

部分州农业厅拥有自已的综合性化验室，有些则认定本州赠地法大学（专用术语）农学院的相关化验室为农业厅的化验室，这些化验室负责分析肥料检查员抽检的肥料样品。经化验被判定为不符合标准要求或与标识不符的肥料产品，农业厅将依照本州的肥料法实施处罚。

美国植物食品管理机构协会是一个南美围各州以及加拿大、波多黎哥两国的肥料管理机构人员组成的社会团体，美国各州农业厅负责肥料管理的处长都是该协会的会员。协会的宗旨是：促进肥料立法的一致性与有效性；鼓励、倡导应用适宜、高效的肥料采样和分析方法；开发高水平的肥料监查技术并强制执行；推广适宜的肥料标识和肥料安全使用方法；开展信息交流、研讨与合作；与企业合作，推进安全用肥，保护水土资源。