很多人将农产品品质下降归咎于化肥的广泛施用，其实农产品的品质主要取决于品种的特性，栽培管理措施也对农产品品质有一定的影响。农产品品质的下降与施用化肥关系不大，相反正确地施用化肥还能提高农产品品质。

植物正常的生长发育需要16种营养元素，缺乏某种营养元素都会影响作物品质。例如，氮肥不足会造成小麦等禾本科作物蛋白质含量下降，从而影响其品质，补充足够的氮素能提高作物蛋白质含量。施用磷肥可增加果实中的糖分，能使西瓜甜味增加。目前几种严重影响农产品质量的生理病害都是由于没有合理施肥造成的，如缺钙引起的大白菜干烧心、缺钾引起的西红柿条腐病等，所以，正确施用化学肥料反而能提高农产品品质。