药肥究竟是“肥”还是“药”，首先关系到一个行业的准入门槛高低。云南农药研究所某专家介绍，要想取得农药登记证，一般都要经过“二年五省”的田间药效试验以及一年的农药残留试验，整个流程耗资几十万。

江苏省农科院资环中心研究员邵建华认为：药肥并不能等同于农药。药肥的特点是“以肥带药”,含药量少，含肥量大，肥料在其中作为分散剂使用，安全性要求应可以适当降低。按照农药口登记，厂家就不能在包装标签上标明肥料养分、含量等指标，这显然也不利于市场监管。

中国农科院植物保护研究所陈福良研究员认为，药肥概念判定的关键是以谁为主，不能仅从量上考虑，还得从成分活性和施用效率上分析。在药肥中，肥料仅仅是填充剂而已，农药含量虽少，但其效率显然是大大超过前者的。

广西田园生化股份有限公司是国内知名的药肥生产企业。其产品部经理唐静认为，从企业角度来讲，当然希望把药肥归入肥料类别，这样登记时间快、费用低，有利于减轻企业负担；但考虑防范药害和保障食品安全，药肥作为农药管理似更科学。唐静介绍，国内真正意义上的药肥生产企业现仅有十家左右，较大的只有三家。

广东惠州中迅集团无形资产办公室颜主任抱怨，作为国内最大的药肥生产企业之一，他们经常遭遇不公正执法。很多地方工商、质检部门分不清药肥到底是按药还是按肥来管理，找企业索要肥料登记证，甚至开具罚款单，给企业形象和产品销售造成很大负面影响。