黄瓜靶斑病主要发生在结瓜盛期，以危害叶片为主，由中下部叶片向上逐步发展，严重时蔓延至叶柄、茎蔓及瓜条。叶片的正反面均可受害。

叶片发病初期病斑为黄褐色水浸状斑点，直径约1毫米左右，对光看小点透明。当病斑直径扩展至1.5～2毫米时，叶片正面病斑略凹陷，病斑近圆形或稍不规则。患病组织与健康组织界限明显。当病斑扩展至3～4毫米时，病斑多为圆形，少数多角形或不规则形，易穿孔，叶正面病斑粗糙不平，病斑整体褐色，中央呈灰白色、质薄呈半透明。

后期病斑直径可达10～15毫米，圆形或不规则形，病斑中央常有一明显的眼状靶心（靶斑病由此得名），病斑大多呈轮纹状。湿度大时正反叶片病斑上可生有稀疏灰黑色霉状物，为病菌的分生孢子梗和分生孢子。病斑大小为3～30毫米，以10～15毫米中型斑较多。

高温高湿时，病菌繁殖快，病斑扩展快，形成大病斑；低温、低湿形成小病斑。严重时多个病斑连片，呈不规则状。发病严重时，病斑面积可达叶片面积的95%以上，叶片干枯死亡。重病株中下部叶片相继枯死，造成提早拉秧。

瓜条染病，出现水浸状近圆形褐色病斑，病斑中心颜色略浅，后期病斑凹陷。