高致病性猪蓝耳病与猪瘟、附红细胞体病、巴氏杆菌病、猪链球菌病、猪传染性胸膜肺炎、沙门氏菌病等多种猪病在临床症状上有相似之处，均有高热、厌食、呼吸困难、共济失调症状，在临床诊断上容易与其它疫病发生混淆。当发生高致病性猪蓝耳病时，猪的免疫功能低下，也可继发猪瘟、附红细胞体病、巴氏杆菌病、猪链球菌病、猪传染性胸膜肺炎、沙门氏菌病等疫病，在临床容易造成误诊。