通常母猪的流产率是2%。经常发现的流产已经形成的胚胎。未成形的胎体易被忽略。这种早期流产仅发现重配率增加及不规律地再发情。因此，有两种流产：第一，是肉眼可见的流产，第二，是在分析繁殖登记时发现高重配率，重配时间的拖长。能够导致母猪流产却没有其他明显病征的传染病有猪布氏杆菌病和钩端螺帽旋体病。母猪配种后一个月才发生流产经常是由钩端螺旋体病引起。猪布氏杆菌症可以在怀孕期的任何阶段造成流产。其他的传染病能引起流产且有其他更明显病征的包括猪呼吸与系列障碍综合症。此病引起母猪的怀孕率及分娩率降低，接着有偏高的死产及离乳前仔猪死亡率。典型猪瘟及伪狂犬病亦可引起母猪流产，唯有完全易感的种猪群爆发猪瘟时有流产现象。每当猪场有流产爆发时，会认为是猪细小病毒（PPV）引起，但PPV绝对不会有流产爆发现象。霉菌毒素也经常被认为是引起流产的原因。