1、古典兽疫（猪瘟、伪狂犬病、口蹄疫、布鲁氏菌病….）未根治，因素性传染病（大肠杆菌病、沙门氏菌病、萎缩性鼻炎、化脓棒状杆菌病、葡萄球菌病、链球菌病、传染性胸膜肺炎、蓝耳病、猪圆环病毒病等）的危害不断增强。

2、某些细菌病和寄生虫病的危害加重

如：大肠杆菌病，链球菌病、传染性胸膜肺炎、支原体病和猪球虫、小袋纤毛虫、鞭虫、附红细胞体等。

3、多病因混合感染，呈现多种综合症。如：高热综合症（猪弓形体病、猪附红细胞体病、猪流感、猪瘟、伪狂犬病、蓝耳病、猪胸膜肺炎），腹泻综合症（大肠杆菌病、沙门氏菌病、传染性胃肠炎、猪流行性腹泻、猪轮状病毒、猪瘟、猪圆环病毒病），呼吸综合症（猪气喘病、胸膜肺炎、蓝耳病、猪圆环病毒病），母猪繁殖障碍综合症（乙型脑炎、猪细小病毒病、伪狂犬病、蓝耳病）

4、耐药性菌株增加。

5、饲养方式及环境对某些疫病造成影响。如种猪采用限位饲养，肢蹄病、胃溃疡和生殖系统疾病明显增加。

6、猪场设计规模越大，疫病传播速度加快。有文献指出，当一头携带病原微生物的猪进入一个群体后，疫病从一头猪传给其它猪的可能数量（N）与猪群中猪的数量（n）的关系是N=n²-n.

7、频繁引种及商品猪频繁调运使得不同地域间、不同繁育体系（场）间疫病传播越来越多。如密螺旋体病、萎缩性鼻炎、蓝耳病、伪狂犬、口蹄疫的流行即与此相关。

8、规模猪场（年出栏5000头以上）设计过于密集，粪尿淤积加上废弃的垫料、饲料残屑及冲洗栏舍的污水一旦处理失当，就会成为病原微生物的孳生地、栖息地，给生产防疫带来无穷的隐患。